Instalando Rpy - Diferentes versões de R
14 04 2014
Para instalar o rpy é necessário ter o R instalado em uma versão menor que a "3". Para tanto é necessário que se faça o download da versão desejada e a compile com especial atenção
$ cd ~
$ wget -c http://cran.r-project.org/src/base/R-2/R-2.15.1.tar.gz
$ tar -xzv R-2.15.1.tar.gz
$ cd R-2.15.1
$ ./configure --enable-R-shlib # Isto é indicação do **rpy**
$ make
Depois disso é necessário instalar o rpy, que tem alguns poréns. O primeiro deles é ao identificar qual a versão do R que se deve utilizar. Baixe o arquivo aqui
$ export RHOMES=$HOME/R-2.15.1
Ou inserir diretamente a linha no seu .bashrc
$ vim ~/.bashrc
export RHOME=~/R-2.15.1
A segunda etapa é modificar o arquivo setup.py, de acordo com a postagem Instalando Rpy, substituindo a biblioteca 'Rlapack' por 'lapack'.
O terceiro passo, o qual gerou tanta dor de cabeça, é o fato do Rpy manter um erro de REGEX no seu código.
Para isso é necessário modificar a sentença:
$ tar -xzv rpy-1.0.3.tar.gz
$ cd rpy-1.0.3
$ vim rpy_tools.py
Na linha 101 a regex está incompleta:
version = re.search(" +([0-9]\.[0-9]\.[0-9])", output)
Modifique para:
version = re.search(" +([0-9]\.[0-9]+\.[0-9])", output)
Após isso falta pouco! É necessário alterar o arquivo src/RPY.h
$ cd rpy-1.0.3/src
$ vim RPy.h
Na linha que diz:
#include <Rdevices.h> /* must follow Graphics.h */
Modifique para:
#include <Rembedded.h> /* must follow Graphics.h */
Depois disso tudo:
$ python setup.py install
Enquanto não consigo migrar os meus códigos de rpy, para rpy2, vou quebrando a cabeça para fazer o rpy funcionar. Obrigado novamente ao Jedi Irber, que ajudou a solucionar o problema. =]
Até mais.
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