Instalando Rpy

01 12 2013

Para instalar, você pode fazer o download do pacote Rpy.

Lá vocês vão encontrar dois "sabores" de como acessar o seu R pelo python. Eu prefiro acessar com o Rpy, por ser simples e direto.

O Rpy2 é utilizado por default dentro do Pandas, mas eu acho que é tudo muito truncado. Mais pra frente eu posso falar um pouco mais sobre essa opção.

Descompacte a pasta no seu diretório.

$ unzip rpy-1.0.3a.zip
$ cd rpy-1.0.3
$ python setup.py install

Se você tiver sorte, tudo ocorreu bem... Caso contrário, algumas modificações terão que ser realizadas.

Para versões mais recentes do R, geralmente o Rpy encontra problemas em reconhecer o que chamam de "RHOMES", que é onde fica a instalação do seu R.

Existem algumas soluções para isso, descritas no README do pacote. A que adotei, e pareceu razoável foi a de fazer um link simbólico

$ sudo ln -s /usr/lib/libR.so /usr/local/lib/
$ sudo ldconfig

Deverá ocorrer tudo bem agora... mas senão, deve ser por causa do tipo de bibliotecas que o setup.py está tentando carregar. Geralmente o erro é:

$ /usr/bin/ld: cannot find -lRlapack

Assim, deve trocar a linha do setup.py, para carregar a lapack ao invés de Rlapack

vi setup.py
:/libraries

# deverá apontar para a linha 163 do código
libraries = ['R', 'Rlapack']

# Faça a devida substituição:
libraries = ['R', 'lapack']

E agora basta instalar! Espero que tenha dado certo aí também!

Até mais.

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